در باغ‌وحش نیو هاوس نیویورک، پادشاه حیوانات، گورخر، شترمرغ و اسب آبی با هم دوست هستند و علاوه بر این، "ستاره" نمایش نیز می‌باشند. بنابراین یکی از آنها در انبار ناپدید می‌شود و دیگری فرار می‌کند تا موجود زنده گمشده را پیدا کند. بنابراین، آنها قایق را تا جزیره جمهوری ماداگاسکار - آفریقا دنبال می‌کنند. اما کشتی در دریا واژگون می‌شود، چه اتفاقی خواهد افتاد؟